Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sox9Q04887 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox9Q04887 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms