Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk16Q04735 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdk16Q04735 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdk16Q04735 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms