Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnb1Q03717 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Kcnb1Q03717 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnb1Q03717 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms