Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl7Q03366 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl7Q03366 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms