Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cacna1sQ02789 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1sQ02789 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms