Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb4Q02738 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb4Q02738 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms