Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr1fQ02284 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms