Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ly9Q01965 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ly9Q01965 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms