Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RykQ01887 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RykQ01887 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RykQ01887 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RykQ01887 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RykQ01887 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RykQ01887 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RykQ01887 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms