Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VcpQ01853 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VcpQ01853 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VcpQ01853 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VcpQ01853 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms