Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gbp1Q01514 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbp1Q01514 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms