Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms