Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp4Q00724 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms