Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga4Q00651 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga4Q00651 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms