Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shc1P98083 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shc1P98083 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shc1P98083 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms