Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp1b3P97370 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp1b3P97370 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp1b3P97370 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp1b3P97370 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b3P97370 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b3P97370 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b3P97370 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b3P97370 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b3P97370 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b3P97370 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp1b3P97370 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms