Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf1bP97358 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf1bP97358 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms