Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mesp1P97309 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp1P97309 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms