Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vgll3P85442 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vgll3P85442 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms