Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3f3aP84244 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3f3aP84244 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms