Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hist1h3bP84228 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hist1h3bP84228 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms