Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NyxP83503 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NyxP83503 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NyxP83503 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NyxP83503 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NyxP83503 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NyxP83503 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NyxP83503 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NyxP83503 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NyxP83503 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NyxP83503 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NyxP83503 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NyxP83503 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NyxP83503 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NyxP83503 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NyxP83503 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NyxP83503 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NyxP83503 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NyxP83503 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NyxP83503 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NyxP83503 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NyxP83503 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NyxP83503 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NyxP83503 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NyxP83503 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NyxP83503 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NyxP83503 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NyxP83503 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NyxP83503 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NyxP83503 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NyxP83503 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NyxP83503 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NyxP83503 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NyxP83503 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NyxP83503 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NyxP83503 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NyxP83503 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NyxP83503 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NyxP83503 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NyxP83503 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NyxP83503 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NyxP83503 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NyxP83503 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NyxP83503 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NyxP83503 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NyxP83503 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NyxP83503 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NyxP83503 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NyxP83503 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NyxP83503 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NyxP83503 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NyxP83503 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NyxP83503 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NyxP83503 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NyxP83503 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NyxP83503 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NyxP83503 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NyxP83503 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NyxP83503 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NyxP83503 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NyxP83503 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NyxP83503 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NyxP83503 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NyxP83503 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NyxP83503 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NyxP83503 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NyxP83503 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NyxP83503 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NyxP83503 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NyxP83503 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NyxP83503 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NyxP83503 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms