Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nucb2P81117 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms