Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Gabpb2P81069 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabpb2P81069 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms