Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irx3P81067 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx3P81067 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx3P81067 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx3P81067 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx3P81067 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx3P81067 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx3P81067 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx3P81067 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx3P81067 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx3P81067 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms