Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp9xP70398 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp9xP70398 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms