Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufd1P70362 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms