Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stra8P70278 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Stra8P70278 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stra8P70278 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stra8P70278 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra8P70278 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra8P70278 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra8P70278 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms