Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NficP70255 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NficP70255 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NficP70255 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NficP70255 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NficP70255 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NficP70255 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NficP70255 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NficP70255 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NficP70255 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NficP70255 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NficP70255 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NficP70255 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NficP70255 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NficP70255 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NficP70255 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NficP70255 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NficP70255 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NficP70255 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NficP70255 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NficP70255 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NficP70255 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NficP70255 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NficP70255 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms