Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn5P68500 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn5P68500 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms