Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp2P63044 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp2P63044 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms