Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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