Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uba52P62984 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms