Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps3P62908 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps3P62908 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms