Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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