Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rab1AP62821 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rab1AP62821 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rab1AP62821 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab1AP62821 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab1AP62821 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rab1AP62821 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rab1AP62821 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab1AP62821 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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