Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra1P62812 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms