Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acta2P62737 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta2P62737 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta2P62737 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms