Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rps29P62274 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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