Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vbp1P61759 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vbp1P61759 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms