Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga11P61622 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga11P61622 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga11P61622 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga11P61622 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms