Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnd3P61588 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms