Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abce1P61222 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abce1P61222 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms