Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2nP61089 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2nP61089 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms