Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PlnP61014 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PlnP61014 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PlnP61014 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PlnP61014 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PlnP61014 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PlnP61014 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PlnP61014 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PlnP61014 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PlnP61014 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PlnP61014 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PlnP61014 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PlnP61014 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PlnP61014 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms