Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snap25P60879 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snap25P60879 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snap25P60879 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snap25P60879 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Snap25P60879 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snap25P60879 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snap25P60879 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Snap25P60879 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Snap25P60879 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms