Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ActbP60710 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ActbP60710 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ActbP60710 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ActbP60710 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ActbP60710 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ActbP60710 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ActbP60710 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ActbP60710 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ActbP60710 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ActbP60710 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ActbP60710 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ActbP60710 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ActbP60710 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ActbP60710 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ActbP60710 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ActbP60710 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ActbP60710 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ActbP60710 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ActbP60710 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ActbP60710 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ActbP60710 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms