Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppfia3P60469 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia3P60469 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia3P60469 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppfia3P60469 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms