Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup43P59235 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup43P59235 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup43P59235 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms