Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samsn1P57725 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms